Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krcc1Q99JT5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krcc1Q99JT5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms