Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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