Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms