Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rhbdd2Q8VEK2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms