Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BbxQ8VBW5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BbxQ8VBW5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms