Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SdsQ8VBT2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms