Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms