Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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