Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrrtm1Q8K377 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrrtm1Q8K377 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrrtm1Q8K377 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrrtm1Q8K377 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrrtm1Q8K377 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrrtm1Q8K377 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm1Q8K377 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lrrtm1Q8K377 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lrrtm1Q8K377 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lrrtm1Q8K377 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lrrtm1Q8K377 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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