Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim68Q8K243 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms