Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHS8

Vps37a, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37aQ8CHS8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vps37aQ8CHS8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps37aQ8CHS8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms