Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SltmQ8CH25 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms