Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp27Q8CEG8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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