Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc73Q8CDM4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms