Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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