Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp38Q8BW70 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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