Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Clrn3Q8BHH8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Clrn3Q8BHH8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Clrn3Q8BHH8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Clrn3Q8BHH8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn3Q8BHH8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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