Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms