Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed4Q80WQ9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Zbed4Q80WQ9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Zbed4Q80WQ9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zbed4Q80WQ9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zbed4Q80WQ9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zbed4Q80WQ9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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