Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnupnQ80W37 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms