Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdp1Q7TSG2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms