Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms