Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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