Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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