Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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