Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6DFW0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms