Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Cntn4Q69Z26 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Cntn4Q69Z26 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Cntn4Q69Z26 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cntn4Q69Z26 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cntn4Q69Z26 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cntn4Q69Z26 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn4Q69Z26 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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