Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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