Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms