Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms