Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ss18Q62280 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ss18Q62280 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ss18Q62280 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ss18Q62280 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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