Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms