Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PcolceQ61398 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms