Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms