Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PtprnQ60673 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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