Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NacadQ5SWP3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NacadQ5SWP3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms