Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf3Q5HZG4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms