Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xirp2Q4U4S6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms