Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Syne3Q4FZC9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Syne3Q4FZC9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Syne3Q4FZC9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Syne3Q4FZC9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Syne3Q4FZC9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Syne3Q4FZC9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Syne3Q4FZC9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Syne3Q4FZC9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Syne3Q4FZC9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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