Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BC051142Q3V0M8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC051142Q3V0M8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BC051142Q3V0M8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BC051142Q3V0M8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BC051142Q3V0M8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BC051142Q3V0M8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BC051142Q3V0M8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BC051142Q3V0M8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BC051142Q3V0M8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC051142Q3V0M8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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