Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933416C03RikQ3V063 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933416C03RikQ3V063 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms