Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms