Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn4Q3UWL8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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