Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms