Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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