Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms