Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Snx27Q3UHD6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Snx27Q3UHD6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Snx27Q3UHD6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Snx27Q3UHD6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snx27Q3UHD6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx27Q3UHD6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms