Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms