Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms