Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rnf180Q3U827 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rnf180Q3U827 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rnf180Q3U827 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rnf180Q3U827 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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